由于營改增過程中，政府通過以往的納稅企業(yè)營業(yè)稅記錄，以及營改增的新舊稅率計算，是能夠相對準確預估營改增的減稅金額。因此，這一減稅過程，可以“精確控制”。

       以上海為例，從實際情況也可以看到，大部分試點地區(qū)，都有較為明顯地減少稅負情況。“營改增”實行以來，上海區(qū)域內合計減稅約200 億元。截至2013年2 月底，全市共有16.4 萬戶企業(yè)納入了“營改增”試點范圍，比年初的11.8萬戶新增了4.6 萬戶，其中新增試點服務項目的企業(yè)為2 萬戶，新辦企業(yè)為2.6
萬戶。但是營改增對部分交通運輸子行業(yè)來說，減稅效果并不樂觀。 從2012 年底國家統(tǒng)計局上海調查總隊的調查情況來看，58.6％的交通運輸業(yè)受訪企業(yè)反應稅負增加。

       我們認為，主要是兩大方面的原因帶來交通運輸企業(yè)一般納稅人稅負增加。一方面，交通運輸企業(yè)11%的增值稅稅率，不僅高于原先3%的營業(yè)稅稅率，還高于試點的中其他現(xiàn)代服務業(yè)（有形動產租賃除外）6%的增值稅稅率。這一稅率的設置無疑是交通運輸企業(yè)稅負增加的直接原因。

       另一方面，交通運輸企業(yè)抵扣的不充分帶來“進項稅額”偏少。這里包括幾個層面的具體原因：
 
       第一，“營改增”試點納入的服務行業(yè)僅限于“6+1”，而對于交通運輸企業(yè)主要成本中的過路過橋費、人工工資、保險費和場地租金都還沒有納入增值稅抵扣的范圍，尤其過橋費能夠占到企業(yè)成本的三分之一以上；
 
       第二，由于企業(yè)經營周期的原因，交通運輸企業(yè)可以用作抵扣的車輛等固定資產已經在試點前購買，試點后無法進行抵扣；

       第三，在實際中，對于能抵扣的油料費用，運輸企業(yè)有時拿不到正式的增值稅專用發(fā)票，這也減少了運輸企業(yè)的進項稅額。

       第四，試點的地區(qū)范圍還沒全面鋪開，交通運輸企業(yè)從非試點地區(qū)獲得的物流輔助業(yè)服務還不能取得增值稅抵扣發(fā)票。