生物與生物源農藥的開發，即用于防治病、蟲、草害等有害生物的生物體本身及源于生物并可作為農藥的各種生物活性物質。
　　 
　　生物源農藥：進展最快的是木霉類和粘帶霉類。它們對立枯病、猝倒病、菌核病引起的病害防效比較突出。
　　 
　　動物源農藥：主要用于害蟲的防治，包括：動物毒素，如蜘蛛毒素、黃蜂毒素、沙蠶毒素等。它們具有調節昆蟲生長發育的功能。昆蟲信息素又稱昆蟲外激素，具有引誘、刺激、抑制、控制昆蟲攝食或交配產卵等功能。農用抗菌素，如具有殺螨作用的瀏陽霉素、華光霉素、多沙霉素等，具有防真菌病害的武夷霉素、多米霉素、多抗霉素，具有防細菌病害的中生霉素、新植霉素，防病毒的寧南霉素等。最具代表性的是阿維菌素。

　　植物源農藥：近年來對印楝、川楝、銀杏、苦皮藤這些植物投入了很多力量進行開發研究，如 綠帝 和 銀泰 就是山東萊陽農學院開發出的對蚧螨有觸殺作用的新的植物源農藥。世界上有幾十萬種植物，對其化學性質進行過研究的僅占10％左右，我國植物種類繁多，特別是華南、海南地區，開發植物源農藥潛力很大。從天然活性物質中尋找綠色化學農藥的先導化合物也是很有潛力的。

　　植物農藥（轉基因植物）：用轉基因技術培育的抗蟲作物、抗除草劑作物也被稱為植物農藥。